Насчет некрасиво - по правилам, штамп выставляется в паспорте. Просьба не ставить штамп в паспорт, когда там еще пять страниц чистых, звучит как-то странно. Что же касается того, что куда-то потом не пустят - почему это должно интересовать израильскую погранслужбу? В подобной ситуации выставление штампа не в паспорт является de facto признанием легитимности отношения к Израилю в тех странах, куда потом не пустят.